Nejistý osud elektrárny Chvaletice je pro Ministerstvo životního prostředí vysoce rizikový. Provozovatel elektrárny svým trváním na udělení nezákonně rozsáhlé výjimky a postup krajského úřadu i ministerstva za předchozího vedení způsobili, že elektrárna nemá platnou výjimku z emisních limitů. To může vést k tomu, že elektrárna nebude moci být v zimním období legálně provozována. V takovém případě existují dvě špatné možnosti dalšího dění.